La cave
Les trois premières semaines, les jeunes Comté sont conservés à 11 °C en cave de pré-affinage où ils reçoivent des soins quotidiens. Ils sont frottés avec de la morge, un mélange d’eau et de sel, et retournés deux fois par semaine.
Ils passeront ensuite deux mois en cave chaude à 16 °C où ils seront frottés une fois par semaine. Puis, ils resteront au moins 4 mois, en cave froide à 6 °C.
Le passage en cave chaude favorise le développement de certains types d’arômes, alors qu’en cave froide, la transformation du fromage est plus lente et les arômes développés différents.